Am nächsten Tag rufen die Tiere alle Kinder aus der Nachbarschaft zusammen. Sie verbünden sich gegen Brundibár, der vergebens versucht, dem Singen der Kinder ein Ende zu machen. Endlich wenden sich ihnen auch die Erwachsenen zu und zeigen sich großzügig. Aninka und Pepicek können nun mit ihren Liedern Geld verdienen, um ihrer Mutter die benötigte Milch zu kaufen. Der unbarmherzige Leierkastenmann jedoch schleicht sich heran und stiehlt ihnen das Geld. Aber alle Kinder und die Tiere nehmen die Verfolgung auf und besiegen ihn schließlich. Endgültig wird Brundibár aus der Stadt gejagt.

Der Text des Finales der Oper:
„Ihr müsst auf Freundschaft bau´n, den Weg gemeinsam geh´n,
auf eure Kraft vertrau´n und zueinandersteh'n.
Dann wird man auf euch schau´n, schlau euch und klug nennen,
denn euch kann nichts trennen.
Wir schlugen Brundibár und jetzt ist allen klar,
uns kann man nicht trennen, ...
Freundschaft alle Zeit hilft euch in jedem Streit
und schafft Gerechtigkeit.
Nehmt euch bei der Hand
und knüpft das Freundschaftsband!“

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